Im Rahmen des aktuellen Lizenzierungsverfahrens für die Regional- und die NRW-Liga, wurde der Gesellschaftsvertrag der Fortuna Köln Spielbetriebsgesellschaft mbH vom 30.01.2009 mit Beschluss vom 16.02.2010 geändert und das Stammkapital von 25.000,00 EUR auf 1.000.000,00 EUR erhöht. Damit sind die Zulassungs- und Teilnahmevoraussetzungen erfüllt, die der Deutsche Fußball-Bund e.V. (DFB) für Kapitalgesellschaften in der Regional- bzw. 3. Liga und der WFLV e.V. für die NRW-Liga zwingend vorsehen.
Um die finanziellen Vorraussetzungen für die sportliche und wirtschaftliche Weiterentwicklung der Fortuna Köln Spielbetriebsgesellschaft mbH zu schaffen, wurde seitens des S.C. Fortuna Köln e.V. die Kapitalmehrheit (99,745 % mit einer 10 %-Rückkaufoption für den S.C. Fortuna Köln e.V.) an Investoren rund um die deinfussballclub.de DFC GmbH abgetreten. Nach wie vor verfügt der S.C. Fortuna Köln e.V. gemäß den Regularien des DFB über 51 % der Stimmrechte in der Gesellschafterversammlung. Des Weiteren stellt der S.C. Fortuna Köln e.V. einen der beiden Geschäftsführer der Fortuna Köln Spielbetriebsgesellschaft mbH. Zudem wird der Beirat der Fortuna Köln Spielbetriebsgesellschaft mbH mehrheitlich durch den S.C. Fortuna Köln e.V. besetzt.